Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HmgcrQ01237 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms