Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VegfaQ00731 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VegfaQ00731 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms