Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SeleQ00690 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SeleQ00690 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SeleQ00690 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SeleQ00690 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SeleQ00690 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SeleQ00690 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SeleQ00690 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SeleQ00690 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms