Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga4Q00651 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms