Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pax8Q00288 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms