Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx2Q00262 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx2Q00262 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms