Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gbp10Q000W5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbp10Q000W5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms