Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shc1P98083 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shc1P98083 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms