Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VegfdP97946 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VegfdP97946 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms