Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc35b1P97858 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc35b1P97858 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc35b1P97858 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc35b1P97858 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc35b1P97858 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc35b1P97858 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc35b1P97858 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc35b1P97858 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms