Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IhhP97812 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IhhP97812 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IhhP97812 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IhhP97812 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IhhP97812 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IhhP97812 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms