Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Xrn1P97789 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Xrn1P97789 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms