Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
rp9P97762 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
rp9P97762 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
rp9P97762 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
rp9P97762 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
rp9P97762 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
rp9P97762 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
rp9P97762 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
rp9P97762 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
rp9P97762 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
rp9P97762 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
rp9P97762 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms