Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smarcc1P97496 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smarcc1P97496 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms