Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bop1P97452 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms