Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SgcaP82350 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcaP82350 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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