Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gabpb2P81069 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms