Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Otx2P80206 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Otx2P80206 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms