Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctps1P70698 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctps1P70698 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms