Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cux2P70298 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cux2P70298 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms