Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif1P70284 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif1P70284 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms