Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad54lP70270 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad54lP70270 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms