Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Traf5P70191 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Traf5P70191 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms