Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnab1P63143 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms