Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Rps29P62274 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Rps29P62274 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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