Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lmo4P61969 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lmo4P61969 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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