Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ufm1P61961 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ufm1P61961 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms