Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg6P61406 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg6P61406 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms