Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psme3P61290 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms