Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scarf2P59222 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scarf2P59222 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms