Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Setd4P58467 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd4P58467 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms