Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dpf3P58269 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms