Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NcstnP57716 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NcstnP57716 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms