Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bace1P56818 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms