Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GferP56213 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GferP56213 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms