Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdh5P55284 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdh5P55284 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms