Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fdft1P53798 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fdft1P53798 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms