Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fgd1P52734 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms