Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms