Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apobec1P51908 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms