Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LumP51885 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LumP51885 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LumP51885 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LumP51885 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LumP51885 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LumP51885 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LumP51885 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LumP51885 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LumP51885 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LumP51885 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LumP51885 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LumP51885 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LumP51885 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LumP51885 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms