Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt6aP50446 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms