Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HpdP49429 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HpdP49429 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HpdP49429 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HpdP49429 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HpdP49429 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HpdP49429 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms