Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox8bP48772 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms