Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prox1P48437 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms