Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr7P47774 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr7P47774 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms