Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic1P46684 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic1P46684 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms