Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sipa1P46062 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms