Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmx2P43687 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmx2P43687 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms