Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtgfrP43117 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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PtgfrP43117 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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PtgfrP43117 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtgfrP43117 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtgfrP43117 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtgfrP43117 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PtgfrP43117 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PtgfrP43117 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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